1991 yılında Marmara Eğitim Kurumları, 1996 yılında İstanbul Marmara Eğitim Vakfı (İMEV) ve 1997 yılında da Maltepe Üniversitesi (MÜ) kurulmuştur. 4282 sayılı kanunla kurulan ve 2547 sayılı kanunun vakıf ve yükseköğretim kurumlarına ilişkin yasa ve yönetmelik hükümlerine tabi bir kamu tüzel kişiliği olan MÜ, 1997 yılında ek kontenjandan öğrenci alarak öğretime başlamıştır.

Maltepe Üniversitesinin bağlı olduğu İMEV, özellikle eğitim, sağlık, çevre, kültür, sanat ve sosyal alanlarda kapsamlı hizmetler vererek vakıf geleneğini sürdürmektedir.

2002 yılında İMEV başta olmak üzere Marmara Eğitim Kurumları’nı bir araya toplamak amacı Marmara Eğitim Köyü, çam ormanlarının arasında 1000 dönüm açık, 300 dönüm kapalı alanda kurulmuştur. Maltepe Üniversitesinin yer aldığı bu yerleşkede Eğitim, Güzel Sanatlar, Hukuk, İletişim, İnsan ve Toplum Bilimleri, İşletme ve Yönetim Bilimleri, Mimarlık ve Tasarım, Mühendislik ve Doğa Bilimleri, Tıp Fakülteleri; Konservatuvar, Hemşirelik Yüksekokulu, Yabancı Diller Yüksekokulu ve Meslek Yüksekokulu ile Fen Bilimleri, Sağlık Bilimleri ve Sosyal Bilimler Enstitüleri yer almakta ve ön-lisans, lisans, yüksek lisans ve doktora programları yürütülmektedir. Tıp Fakültesindeki öğretimin bir bölümü Maltepe merkezdeki Maltepe Üniversitesi Hastanesi kompleksine yapılmaktadır. Bugün Üniversitemizde, 9 fakülte, 3 enstitü, bir konservatuvar, 2 yüksekokul ve bir meslek yüksekokulu ile eğitim-öğretim hizmeti verilmekte, bilimsel araştırma ve yayınlarla Türk ve dünya bilimine katkıda bulunmaya çalışılmaktadır. Kampus alanında ayrıca 8.000 kişilik Marmara Açık Hava Tiyatrosunun yanı sıra 2000 metrekarelik iki film ve televizyon platosu yer almaktadır.

Üniversitemiz eğitim ilkeleri; "Düşüncede özgür, eğitimde çağdaş, bilimde evrensel" sloganında özetlenmiştir. Üniversitenin ana hedefi; cumhuriyetin temel ilkelerini özümsemiş, Atatürkçü, laik, demokrasinin tüm kurallarına uyan, aktif, akılcı, düşünen, okuyan, araştıran, üreten, dünya gençliği ile her alanda yarışabilen, çağdaş ve aydın gençleri Türkiye'nin geleceğine hazırlamaktır.

Maltepe Üniversitesi uluslararasılaşmaya büyük önem vermektedir. Bu amaçla, öğrenci ve öğretim üyesi değişimi, ortak araştırma ve bilimsel çalışmalar için dünyadaki saygın üniversitelerle güçlü bağlantılar kurulmuş olup, bunların sayısı her yıl artırılmaktadır. Uluslararası değişim programları ve çift diploma programları Maltepe Üniversitesinin uluslararası karakterinin bir göstergesidir. Ayrıca, 2010 yılında lisans; 2012 yılında yüksek lisans mezunlarına Diploma Eki verilmeye başlanmıştır.