Iğdır Üniversitesinin temeli, Iğdır Meslek Yüksekokulu’na dayanır. 1995 yılında Kafkas Üniversitesi’ne bağlı olarak kurulan Iğdır Meslek Yüksekokulu ilk yılında sadece İşletmecilik bölümüyle, 20 öğrencisine, 16 okutman, 1 hizmetli ve 1 memur ile hizmet vermeye başlamıştır.
Hızla büyüyen Iğdır MYO kısa sürede 8 örgün ve 5 ikinci öğretim programıyla 1500’ü aşkın öğrenciye hizmet verir hale gelmiş, 2001 yılından itibaren süregelen fakülte kurulması girişimleri 2006 yılında sonuç vermiş ve değerli tarım alanlarına sahip ilimiz, Kafkas Üniversitesine bağlı olarak Iğdır Ziraat Fakültesine kavuşmuştur.
2.05.2008 tarihinde, Yükseköğretim Kurumları Teşkilatı Kanununun Ek 100. Maddesi uyarınca, bünyesinde 3 fakülte, 2 meslek yüksekokulu ve 3 enstitü ile Iğdır Üniversitesi resmi olarak kurulmuştur. Iğdır Ziraat Fakültesi, yoğun çabalar sonucu 2008 ÖSS kılavuzundaki yerini almış ve 30 öğrencisiyle 2008-2009 eğitim-öğretim yılında, faaliyetlerine başlamıştır.

2008 yılından bu yana, gerek fiziksel gerekse akademik anlamda kuruluş evresini büyük oranda tamamlayan üniversite, bugün itibariyle, 7 fakülte, 2 yüksekokul, 4 meslek yüksekokulu,3 enstitü, 6 koordinatörlük, 18 uygulama ve araştırma merkezinin yanında toplam 278 akademik,199 idari, 164 yardımcı personeli ve 3366 önlisans, 2516 lisans, 495 yüksek lisans ve 3 doktora öğrencisi olmak üzere toplam 6380 öğrencisi ile bölgemiz ve Türkiye’nin saygın üniversitelerinden biri olma yolunda emin ve kararlı adımlarla ilerlemektedir.